第一，险种不同。
个人社保，按照《社会保险法》的规定，只能包括基本养老保险和基本医疗保险。
公司社保，可以包括基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、生育保险、失业保险五种。
而且公司社保，还可以缴纳补充养老保险和补充医疗保险，好的国有企业和事业单位，建立了企业年金或职业年金。现在一些发达地区工会也在组织工会互助保险。
一些单位还给职工缴纳商业意外保险，主要是一些市政清洁工人或者高危风险行业。
有两种保险，企业不能缴纳，就是城乡居民养老和医疗保险。
城乡居民养老和医疗保险只能是个人参保，属于户籍居民的利益，多数地区只能在户籍地缴。现在一些地区为了照顾外来打工人员，也允许外来打工者可以在当地缴纳城乡居民医疗保险，但基本不包括城乡居民养老保险。
第二，费用承担不同。
个人缴纳职工社保，一般是通过确认自己灵活就业人员身份的方式自己缴纳。
包括居民社保在内，都是有个人承担全部的社会保险费。
企业缴纳社保，工伤保险、生育保险、商业保险，一般都是由用人单位全额承担。基本养老保险，基本医疗保险，失业保险，是由企业和个人承担。
参加企业缴费的职工，基本养老保险和基本医疗保险个人承担的比例全国相同，都是交费基数的8%和2%。而且国家也规定，个人交纳的钱数全部进入个人账户。
灵活就业人员保险，也是按照8%和2%的比例划入个人账户，但是个人承担的钱数要多。
第三，缴费费率不同。
企业缴纳社保，往往承担的费率要高。由于企业缴纳社保一般分为两部分，个人承担部分和企业承担部分。个人承担部分的缴费比例，就是上述所说的8%和2%。
另外失业保险个人承担部分是1%以下，各地可以自我调节。农村户籍人员，《失业保险条例规定》不用个人缴纳失业保险。
企业承担的养老保险缴费费率一般是13%到20%，养老保险基金收支压力越重的地区，缴费比例就越高。
灵活就业人员参加缴费，国家在养老保险交费方面往往有所照顾，一般是按照总和20%的比例缴费，比企业缴费比1%到8%的缴费比例。杭州市按照18%的比例缴费，非常优惠。
灵活就业人员参加基本医疗保险，像烟台等一些地区专门开发了没有医疗保险个人账户部分的职工医保，也能有效降低个人负担。缴费费率能够下降3.5%左右。
另外灵活就业人员自己缴纳社保，只要是就业困难人员，就可以享受3到5年的就业困难以后就业人员社保补贴，一般能够补贴个人交费费用的50%到66%。也是相当不错的。
第四，险种不同，衔接情况也不一致。
城乡居民养老保险和职工养老保险，虽然可以相互衔接，但是仅仅是个人账户的衔接，城乡居民养老保险的缴费年限不可以用作职工养老保险退休计算待遇。
城乡居民医疗保险，不能和职工医疗保险相互衔接，除非当地有更高档次的缴费保险种类。
第五，个别退休年龄不同。
一些地区女性灵活就业人员退休年龄是55岁，但是企业职工退休年龄是50岁。各地在相互衔接上有问题，比如淄博等地允许在企业工作满十年以上，就可以按照50岁退休，有的地方不可以。
所以，尽管有上述的不同，但是缴纳的是相同的保险，在各种待遇方面是完全一致的，包括养老金公式和医保报销比例，大家可以放心的。
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